1958年7月，為加快安徽建設，改變皖北地區(qū)人民群眾缺醫(yī)少藥的局面，國家決定由原上海第二醫(yī)學院（現(xiàn)上海交通大學醫(yī)學院）以及安徽醫(yī)學院（現(xiàn)安徽醫(yī)科大學）援建創(chuàng)立蚌埠醫(yī)學院。

學校是國家首批卓越醫(yī)師教育培養(yǎng)計劃試點高校、全國首批專科醫(yī)師規(guī)范化培訓基地、國家級大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)實踐基地和國家級大學生校外實踐教育基地、教育部臨床醫(yī)學“5+3”改革試點高校。學校是國家首批具有學士和碩士學位授予權單位，是教育部碩士研究生推免高校，是陸軍軍醫(yī)大學、暨南大學博士研究生聯(lián)合培養(yǎng)單位，是安徽省博士學位授予立項建設單位，是安徽省博士后崗位設置單位。

學校坐落于淮河流域重要的交通樞紐城市——蚌埠，瀕臨千里淮河，承山水涵養(yǎng)之靈氣，傳杏林濟世之流芳,現(xiàn)有龍子湖校區(qū)、治淮校區(qū)、宏業(yè)校區(qū)、淮上校區(qū)和高鐵校區(qū)，占地面積1751.8畝，是安徽省園林式單位和綠化模范單位，安徽省首屆教育系統(tǒng)文明單位和安徽省第十一屆文明單位。

學校現(xiàn)有教職醫(yī)護員工近6000人（含直屬附屬醫(yī)院），專任教師1054人，其中教授179人、副教授392人，碩士生導師909人、聯(lián)合培養(yǎng)單位博士生導師29人，具有博士學位的教師322人，碩士學位的教師644人。學校有國家杰青、國家重點研發(fā)計劃首席科學家、享受國務院和省政府特殊津貼專家等60余人，全國優(yōu)秀教師、全國模范教師、省教學名師、教壇新秀等93人，省學術和技術帶頭人及后備人選、省特支計劃、江淮名醫(yī)等84人，皖江學者4人。學校擁有2所直屬附屬醫(yī)院、9所非直屬附屬醫(yī)院，承擔了皖北地區(qū)近3000萬人口醫(yī)療服務任務，輻射淮河流域和周邊省份。

學校現(xiàn)擁有醫(yī)學、理學、工學、管理學等學科門類，30個本科專業(yè)，全日制在校本科生12176名，碩士研究生2754名（含碩士留學生13人），有7個一級學科碩士學位授權點和7個碩士專業(yè)學位授權類別，臨床醫(yī)學學科進入ESI全球排名前1%。學校擁有3個國家級一流本科專業(yè)、1個國家級特色專業(yè)、1個國家級綜合改革試點專業(yè)、12個省級特色（一流、品牌）專業(yè)、11個省級綜合改革試點專業(yè)，3個國家臨床重點專科、4個省級重點學科、3個省級高校高峰（培育）學科、30個省級重點專科和重點培育專科、2個省級特色專科，4個省級診療中心，3個國家級科研平臺，2個國家藥物臨床實驗機構，省重點實驗室、臨床醫(yī)學研究中心等省級平臺6個，省人文社科重點研究基地等教育廳平臺5個，1個國家級臨床技能綜合培訓中心，9個省級示范實驗實訓中心，3個省級虛擬仿真實驗教學中心，3個省級及以上人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)。

學校充分發(fā)揮高校科研人才優(yōu)勢，積極服務地方經(jīng)濟社會發(fā)展。近年來，學校先后承擔省部級及以上科研項目1025項，其中，國家級科研項目32項；獲省部級及以上科研獎勵37項，2人獲國家科學技術進步獎二等獎；獲國家專利、軟件著作權等知識產(chǎn)權244項，發(fā)表SCI、SSCI檢索收錄論文2471篇，其中在《Science》發(fā)表研究型論文2篇；主編國家規(guī)劃教材13部，參編42部，公開出版發(fā)行《蚌埠醫(yī)學院學報》《中華解剖與臨床雜志》《中華全科醫(yī)學》3種學術刊物。學校積極開展國內外學術交流活動，先后與美、法、德、日、澳、韓等國以及港澳臺地區(qū)學術機構、高等院校建立了協(xié)作關系。

學校人才培養(yǎng)質量一直保持較高水平。近年來，臨床醫(yī)學專業(yè)畢業(yè)生國家執(zhí)業(yè)醫(yī)師資格考試年均總通過率高出全國平均通過率近8%。2012年以來，學校連續(xù)8屆晉級全國高等醫(yī)學院校大學生臨床技能競賽總決賽，榮獲一等獎1次、二等獎5次、三等獎2次。2021年，學校臨床醫(yī)學、護理學雙雙榮獲“第十屆中國大學生醫(yī)學技術技能大賽”全國總決賽銀獎。2022年，學校獲全國精神醫(yī)學專業(yè)本科生臨床技能大賽特等獎1項、全國大學生生命科學競賽一等獎4項。學校醫(yī)學專業(yè)覆蓋面廣，專業(yè)與就業(yè)崗位吻合度高，畢業(yè)生以“理論基礎實、動手能力強、發(fā)展后勁足”深受用人單位歡迎，畢業(yè)生就業(yè)率位居安徽省前列。

學校始終堅持社會主義辦學方向，貫徹黨的教育方針，落實立德樹人根本任務，把社會主義核心價值觀貫穿于教育教學全過程。近年來，涌現(xiàn)出“最美列車女孩”林雪、路邊救助突發(fā)心腦血管疾病老人的薛帥帥、沖下公交施救路邊昏倒老人的計星勝、路遇傷者積極施救的周青、“最美列車教師”張靜、安徽省道德模范聞仲等眾多感動社會的先進人物。中央電視臺多次專題報道，引發(fā)社會強烈反響，多名師生入選“安徽好人”。

65年來，學校大力弘揚“艱苦創(chuàng)業(yè)、嚴謹治學、精誠為醫(yī)、團結奉獻”的蚌醫(yī)精神，秉承“篤學、精業(yè)、修德、厚生”的校訓，傳承上二醫(yī)優(yōu)良傳統(tǒng)，在長期辦學實踐中，逐步凝練出“固本守教、教授施教、傳幫帶學、反復實踐”的人才培養(yǎng)理念。培養(yǎng)出15萬余名優(yōu)秀醫(yī)藥衛(wèi)生人才，其中既有以劉德培、段樹民、陳孝平、王福生、范先群等5名院士為代表的醫(yī)學領軍人才，也有以教育部長江學者盧洪洲、國家杰出青年基金獲得者卜軍等為代表的杰出中青年學者和醫(yī)學管理人才，以及以“白求恩獎章”獲得者劉曉林為代表的大批基層優(yōu)秀醫(yī)務工作者，為增進人民群眾健康福祉、促進區(qū)域經(jīng)濟社會高質量發(fā)展做出重要貢獻。

2018年7月，學校第八次黨代會提出建成“全國知名區(qū)域一流的高水平醫(yī)科大學”的奮斗目標。當前，在校黨委帶領下，全校師生醫(yī)護員工凝心聚力、苦干實干，為實現(xiàn)“全國知名區(qū)域一流高水平醫(yī)科大學”的奮斗目標，為新階段現(xiàn)代化美好安徽建設正不懈努力奮斗！